Penerbangan dari Surabaya menuju Merauke berangkat dari Bandara Internasional Juanda dan tiba di Bandara Mopah, Merauke. Durasi waktu yang dibutuhkan untuk melakukan perjalanan udara ini sekitar 6 jam 30 menit, mengingat ada perbedaan waktu dua jam antara dua wilayah (Surabaya UTC +7 dan Merauke UTC +9).

Ada dua maskapai penerbangan yang melayani rute ini, yaitu Wings Air dan Sriwijaya Air. Berikut jadwal penerbangan dari Surabaya menuju Merauke.
Berangkat
Tiba
Maskapai Penerbangan
Frekuensi
10.25 PM
08.10 AM (+1)
Wings Air IW1798
Tiap hari - LANGSUNG
11.00 PM
01.30 AM (+1)
Sriwijaya Air SJ562
Sl Km Sb Mgg - 2h 30m layover in Makassar
04.00 AM
08.30 AM
Sriwijaya Air SJ704
Sl Km Sb Mgg - 2h 30m layover in Makassar

Harga tiket pesawat dari Surabaya menuju Merauke berkisar Rp1,7 jutaan hingga Rp3,2 jutaan. Berikut harga tiket pesawat rute Surabaya menuju Merauke untuk bulan Februari 2016.
Tanggal
Harga Tiket (Rp)
15
3.284.000
16
2.093.000 - 3.180.000
17
1.929.000 - 2.093.000
18
1.929.000 - 1.939.000
19
2.093.000 - 2.503.000
20
2.151.000 - 2.674.000
21
1.998.000 - 2.571.000
22
2.093.000 - 2.571.000
23
2.030.000 - 2.571.000
24
2.076.000 - 2.104.000
25
1.766.000 - 1.966.000
26
1.929.000 - 2.217.000
27
1.929.000 - 2.217.000
28
1.929.000 - 2.217.000
29
2.055.000 - 2.217.000

Sementara, berikut kisaran harga tiket pesawat rute Surabaya-Merauke untuk bulan Maret 2016.
Tanggal
Harga Tiket (Rp)
1
1.766.000 - 1.800.000
2
1.923.000 - 1.939.000
3
1.765.000 - 1.870.000
4
1.765.000 - 1.870.000
5
1.766.000 - 1.870.000
6
1.765.000 - 1.870.000
7
1.899.000 - 1.870.000
8
1.765.000 - 1.774.000
9
1.765.000 - 1.787.000
10
1.765.000 - 1.787.000
11
1.754.000 - 1.787.000
12
1.765.000 - 1.787.000
13
1.763.000 - 1.765.000
14
1.763.000 - 1.765.000
15
1.765.000 - 1.782.000
16
1.754.000 - 1.782.000
17
1.765.000 - 1.782.000
18
1.765.000 - 1.782.000
19
1.765.000 - 1.782.000
20
1.754.000 - 1.782.000
21
1.754.000 - 1.782.000
22
1.765.000 - 1.782.000
23
1.754.000 - 1.782.000
24
1.754.000 - 1.763.000
25
1.754.000 - 1.782.000
26
1.754.000 - 1.782.000
27
1.754.000 - 1.782.000
28
1.765.000 - 1.782.000
29
1.763.000 - 1.802.000
30
1.754.000 - 1.782.000
31
1.765.000 - 1.782.000